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篇1:3种结肠癌细胞株中DLC-1基因的表达及其启动子区的甲基化状态研究
3种结肠癌细胞株中DLC-1基因的表达及其启动子区的甲基化状态研究
目的:研究候选抑癌基因DLC-1在结肠癌细胞株中的表达及其启动子区的甲基化状态,初步探讨结肠癌细胞株DLC-1基因表达水平与其启动子区甲基化的相关性.方法:采用RT-PCR技术分别检测DLC-1基因在人结肠癌细胞株CaCo-2、HT-29和LoVo中的'表达水平;应用甲基化特异性PCR(MSP)方法和亚硫酸氢盐修饰DNA测序检测启动子区域甲基化状态;分别用0、5、10 μmol・L-1浓度的去甲基化药物5氮杂胞苷处理DLC-1基因启动子区域高甲基化状态细胞后,再检测DLC-1基因mRNA表达水平.结果:人结肠癌细胞株CaCo-2和LoVo中DLC-1 mRNA呈阳性表达,HT-29中的表达呈阴性表达;CaCo-2和LoVo细胞DLC-1基因启动子区域未发生甲基化,而HT-29出现启动子区高甲基化状态;经5氮杂胞苷药物干预后,HT-29结肠癌细胞的DLC-1基因表达明显增强.结论:结肠癌细胞株HT-29中DLC-1基因表达沉默与启动子区高甲基化状态有关.
作 者:金月玲 田小强 商延芳 黄培林 JIN Yue-ling TIAN Xiao-qiang SHANG Yan-fang HUANG Pei-lin 作者单位:东南大学基础医学院,病理学与病理生理学系,江苏,南京,210009 刊 名:东南大学学报(医学版) ISTIC英文刊名:JOURNAL OF SOUTHEAST UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCE EDITION) 年,卷(期): 27(1) 分类号:Q754 关键词:DLC-1基因 甲基化 结肠癌细胞株 甲基化特异性PCR篇2:原位移植人肝癌裸鼠模型AFP基因甲基化状态与其表达的关系
原位移植人肝癌裸鼠模型AFP基因甲基化状态与其表达的关系
[目的]探讨原位移植人肝癌模型肝癌组织中,AFP基因启动子区的甲基化状态同其异常表达的'关系.[方法]采用甲基化特异性PCR(MSP)和亚硫酸氢盐测序法(BSP)分析模型肝癌组织中AFP基因启动子区甲基化状态;RT-PCR及Western Blotting两种方法检测AFP基因在转录水平和翻译水平的表达情况.[结果]10例肝癌模型的肝癌组织均有AFP基因mRNA和蛋白的表达(100%),AFP基因启动子区部分CG位点发生异常甲基化,其中-2431、-2494两个位点低于正常对照(P<0.01).[结论]AFP基因启动子区甲基化程度与其表达成负相关(P<0.01).
作 者:于利人 马勇 俞媛 陈立军 YU Li-ren MA Yong YU Yuan CHEN Li-jun 作者单位:于利人,马勇,陈立军,YU Li-ren,MA Yong,CHEN Li-jun(武警医学院,天津,300162)俞媛,YU Yuan(天和医院检验科,天津,3000504)
刊 名:武警医学院学报 ISTIC英文刊名:ACTA ACADEMIAE MEDICINAE CPAF 年,卷(期):2008 17(12) 分类号:O786 关键词:AFP基因 原位移植 DNA甲基化篇3:用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态
用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性
[目的]了解中国人群肿瘤坏死因子α(the tumour necrosis factor α,TNF-α)基因启动子区多态性.[方法]随机选取20名深圳地区汉族健康体检者,采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区(-1389nt~+125 nt),对PCR产物进行序列分析,寻找单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs).采用Taqman MGB探针建立了-857nt(C/T)位点的实时定量PCR(the real-time PCR)分型方法,并对中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体共1 108份样本进行了基因分型.[结果]在启动子区(-1322nt~+67 nt),发现6个SNP位点,即-885(A/G)、-863(C/A)、-646(G/A)、-648(G/A)、-568(G/C)和-857(C/T,其中位点-646 nt(G→A)为新发现SNP.-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同,但测序的20个个体基因分型相同.中国人群-857nt(C/T)位点基因型频率分别为0.79(CC),0.19(CT)和0.02(TT),中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体间无显著性差异.中国人群-857T等位基因频率为0.116,与文献报道的.韩国人群相同,但比日本人群低.[结论]中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守.采用Taqman MGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确,易于自动化,为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具.
作 者:庾蕾 庄志雄 谢富焕 黄海雄 叶小明 YU Lei ZHUANG Zhi-xiong XIE Fu-huan HUANG Hai-xiong YE Xiao-ming 作者单位:深圳市疾病预防控制中心食品/毒理科,广东,深圳,518020 刊 名:中山大学学报(医学科学版) ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF SUN YAT-SEN UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES) 年,卷(期): 27(1) 分类号:Q347 关键词:多态性 肿瘤坏死因子α 单核苷酸多态性 实时定量PCR Taqman MGB探针篇4:抑癌基因ASPP家族在肿瘤细胞株中的表达研究
抑癌基因ASPP家族在肿瘤细胞株中的表达研究
目的:观察抑癌基因ASPP家族在不同肿瘤细胞株中的表达水平,探讨其在肿瘤的发生、发展及预后中的作用.方法:应用单核细胞分离液分离正常人血液单核细胞,用DMEM培养液培养细胞株jurkat、k-562、HL-60、成纤维细胞、HT-29、所得细胞用Tripure分离试剂提取总RNA.最后用RT-PCR检测ASPP mRNA的表达水平.结果:ASPP1与ASPP2 mRNA在正常人细胞中的表达水平比肿瘤细胞株的`表达水平高(P<0.05).iASPP的表达量除在HT-29细胞株中与正常细胞差异无统计学意义(P>0.05),其他肿瘤细胞株的表达量均高于正常细胞的表达量(P<0.01).结论:抑癌基因ASPP家族的促p53细胞凋亡功能在正常细胞转变为恶性的过程中有重要的作用.
作 者:张云 刘泽军 刘彬 张小兵 ZHANG Yun LIU Zejun LIU Bin ZHANG Xiaobing 作者单位:张云,刘彬,张小兵,ZHANG Yun,LIU Bin,ZHANG Xiaobing(解放军第412医院检验科,成都,614100)刘泽军,LIU Zejun(重庆第三军医大学西南医院检验科)
刊 名:临床血液学杂志 英文刊名:JOURNAL OF CLINICAL HEMATOLOGY 年,卷(期): 22(1) 分类号:Q343.1 关键词:ASPP mRNA RT-PCR篇5:P16INK4、Rb基因表达在肺癌发生中协调性研究
P16INK4、Rb基因表达在肺癌发生中协调性研究
采用mRNA原位双杂交和免疫组织化学方法对31例非小细胞肺癌组织进行p1611NK4、Rb基因表达水平及其相关性的研究.结果显示,以Dig-碱性磷酸酶-NBT/BCIP系统检测p16INK4基因转录,阳性结果呈蓝色,阴性杂交率为22.6%(7/31);以Bio-辣根过氧化物酶-AEC系统检测Rb基因转录,阳性结果为红色,阴性率为16.1%(5/31).免疫组织化学检测显示p161NK4蛋白质阴性率为42%(13/31);Rb蛋白表达阴性率为19.4%(6/31).Rb、p16INK4基因在非小细胞肺癌发生中起协同调控作用,以p16INK4基因表达异常为主.
作 者:曹祥荣 张锡然 苏长青 作者单位:曹祥荣,张锡然(南京师范大学生命科学学院,)苏长青(南京军区81医院,)
刊 名:遗传学报 ISTIC SCI PKU英文刊名:ACTA GENETICA SINICA 年,卷(期): 28(7) 分类号:Q344.13 关键词:p16INK4基因 视网膜母细胞瘤基因 原位双杂交 免疫组织化学 肺癌篇6:MYOD基因家族在鸭小肠组织发育中的表达研究
MYOD基因家族在鸭小肠组织发育中的表达研究
为研究生肌调节因子MYOD家族对鸭小肠发育的影响,利用QRT-PCR法检测了MYOD家族各成员mKNA在鸭胚第10、14、18、22、27天及出生后1周小肠平滑肌发育过程中的相对表达量.结果表明,4个基因在鸭小肠发育过程中均有表达,且各自的表达量呈现一定的规律性变化.其中MYF5在第10天的表达量最高,之后总体呈下降趋势,到第27天时又达到一个高峰;MYOD1在第10天时表达量最高,之后急剧下降;MYOG的表达量从第10天开始曲折上升,到第22天时达到高峰,之后逐步下降;MYF6在第10天时表达量最高,之后急剧下降.初步推测,MYOD基因家族可能参与了小肠的.发育或功能的调控.
作 者:陈禧 刘贺贺 李亮 司建民 王继文 作者单位:四川农业大学畜禽品种资源发掘与利用重点实验室,四川雅安,625014 刊 名:中国家禽 PKU英文刊名:CHINA POULTRY 年,卷(期):2010 32(8) 分类号: 关键词:MYOD 平滑肌 发育表达 QRT-PCR★外源超氧化物歧化酶基因MnSOD在玉米中的过量表达及抗逆性的提高
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