下面是小编整理的强大的广谱基因表达分析技术-基因表达系列分析法,本文共3篇,希望能帮助到大家!

篇1:强大的广谱基因表达分析技术-基因表达系列分析法
强大的广谱基因表达分析技术-基因表达系列分析法
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项强大的数字化分析基因组整体表达模式的技术.它的诞生为定量、全局性地分析特定细胞内的'基因表达情况提供了可能.本文介绍了SAGE技术的基本原理、最新进展和应用.
作 者:吴志革 邹方东 WU Zhi-ge ZOU Fang-dong 作者单位:生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院,成都,610064 刊 名:四川动物 ISTIC PKU英文刊名:SICHUAN JOURNAL OF ZOOLOGY 年,卷(期): 25(3) 分类号:Q75 关键词:基因表达系列分析 原理 进展 应用篇2:Pathway Tools可视化分析水稻基因表达谱
Pathway Tools可视化分析水稻基因表达谱
后基因组时代的到来使基因转录组学、蛋白质组学和代谢组学等高通量、多层次的生物研究手段广泛应用于植物科学研究,从海量数据中有效挖掘必要的生物信息成为当今组学研究的瓶颈问题.RiceCyc(www.gramene.ors/pathway/)及其核心软件Pathway Tools是水稻代谢途径分析的有效工具.通过搜索TIGR(ht-tp://www.tigr.ors/tdb/e2k1/osal/)数据库.用Pathway Tools软件的omics viewer工具将耐盐品种FL478和其不耐盐亲本IR29在盐处理条件相对对照条件下的'110个差异表达基因可视化展示在包含362条代谢途径信息的RiceCyc细胞代谢图上,从整体水平上分析了二者对盐胁迫反应的不同.结果表明,在相同的盐胁迫条件下,FL478相对IR29反应明显较快,前者中被诱导的代谢途径主要是能量循环过程如磷酸戊糖途径、糖酵解和三羧酸循环(TCA循环),以及核糖的分解、碳水化合物的利用途径;而后者中表达出现差异的基因主要涉及植物激素的生物合成,细胞结构组分代谢及次级代谢等途径;类黄酮合成途径在IR29中被明显诱导而在FL478中没有变化.
作 者:张晓婷 谢荔岩 林奇英 吴祖建 谢联辉 ZHANG Xiao-ting XIE Li-yan LIN Qi-yiug WU Zu-jian XIE Lian-hui 作者单位:张晓婷,ZHANG Xiao-ting(福建农林大学植物病毒研究所,福建省植物病毒学重点实验室,福建,福州,350002;河南农业大学植物保护学院,河南,郑州,450002)谢荔岩,林奇英,吴祖建,谢联辉,XIE Li-yan,LIN Qi-yiug,WU Zu-jian,XIE Lian-hui(福建农林大学植物病毒研究所,福建省植物病毒学重点实验室,福建,福州,350002)
刊 名:激光生物学报 ISTIC英文刊名:ACTA LASER BIOLOGY SINICA 年,卷(期): 17(3) 分类号:Q786 关键词:水稻 基因表达谱 代谢途径分析 RiceCye数据库 Pathway Tools篇3:家蚕组织蛋白酶D基因的克隆、序列分析及其表达谱研究
家蚕组织蛋白酶D基因的克隆、序列分析及其表达谱研究
组织蛋白酶D(cathepsin D,CtD)是溶酶体内天冬氨酸内切蛋白酶,参与机体多种生理病理过程,尤其在昆虫的发育变态过程中起着重要作用.利用NCBI上登录的组织蛋白酶D基因核酸序列和家蚕Bombyx mori表达序列标签(expressed sequence tags,EST)数据库,进行电子克隆获得家蚕组织蛋白酶D(BmCtD)基因的全长cDNA(DQ010007).该cDNA大小为1 543 bp,其中ORF长1 152 bp,同源性分析表明BmCtD与其他物种的CtD具有较高的相似性.BmCtD的.mRNA存在选择性拼接,另外一种mRNA形式命名为BmCtDⅠ.RT-PCR实验表明该基因在本实验所调查的家蚕不同发育时期和组织中都有表达.
作 者:杨远萍 刘春 王子龙 王根洪 夏庆友 YANG Yuan-Ping LIU Chun WANG Zi-Long WANG Gen-Hong XIA Qing-You 作者单位:西南大学蚕学与生物技术学院,农业部蚕桑学重点实验室,重庆,400716 刊 名:昆虫学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA ENTOMOLOGICA SINICA 年,卷(期):2006 49(2) 分类号:Q966 关键词:家蚕 组织蛋白酶D 克隆 序列分析 表达谱★外源超氧化物歧化酶基因MnSOD在玉米中的过量表达及抗逆性的提高
★3种结肠癌细胞株中DLC-1基因的表达及其启动子区的甲基化状态研究
★应用载体介导的RNAi技术抑制胰腺癌细胞K-RASAsn12的表达
★学生书面表达存在的问题分析及应对策略 (中学英语教学论文)
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