【导语】以下是小编为大家准备的统计学分析方法应用于乳酸乳球菌培养基的优化(共7篇),欢迎大家前来参阅。

篇1:统计学分析方法应用于乳酸乳球菌培养基的优化
统计学分析方法应用于乳酸乳球菌培养基的优化
应用Plackett-Burman设计法对影响乳酸乳球菌发酵的.培养基主要组分进行筛选,确定了影响乳链菌肽效价的关键因素为酵母浸粉、葡萄糖和K_2HPO_4. 在此基础上,采用响应面法(RSM)优化乳链菌肽发酵培养基. 结果表明,当酵母浸粉质量浓度为22.35 g/L,葡萄糖质量浓度为24.80 g/L,K_2HPO_4质量浓度为13.65 g/L时,乳链菌肽产量最大,此时,乳链菌肽产率为2 157 IU/mL. 实验验证,最佳条件下乳链菌肽产率为2 115 IU/mL,预测值与验证值吻合得较好.
作 者:王秀丽 任晓冬 陈萍萍 韩文瑜 滕利荣 WANG Xiu-li REN Xiao-dong CHEN Ping-ping HAN Wen-yu TENG Li-rong 作者单位:王秀丽,WANG Xiu-li(吉林大学,畜牧兽医学院,长春,130062;吉林大学,生命科学学院,长春,130012)任晓冬,滕利荣,REN Xiao-dong,TENG Li-rong(吉林大学,生命科学学院,长春,130012)
陈萍萍,CHEN Ping-ping(延边大学,医学院,吉林,延吉,133002)
韩文瑜,HAN Wen-yu(吉林大学,畜牧兽医学院,长春,130062)
刊 名:吉林大学学报(理学版) ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF JILIN UNIVERSITY(SCIENCE EDITION) 年,卷(期): 48(2) 分类号:Q949.9 关键词:Plackett-Burman设计法 响应面法(RSM) 乳链菌肽 Plackett-Burman design response surface analysis methodology (RSM) nisin篇2:谷胱甘肽在乳酸乳球菌抵抗氧胁迫中的保护作用
谷胱甘肽在乳酸乳球菌抵抗氧胁迫中的保护作用
为研究谷胱甘肽(GSH)在乳酸乳球菌NZ9000抗氧胁迫中的生理作用,以能够生物合成GSH的重组菌NZ9000(pNZ3203)为实验菌株进行了研究.结果表明,在较高H2O2胁迫剂量(150mmol/L H2O2,15min)下,前培养3h、5h和7h(即乳酸链球菌素诱导1h、3h和5h)时的重组菌细胞的.存活率分别是处于相应生长时期对照菌NZ9000 (pNZ8148)的1.8±0.1倍、2.6±0.1倍和2.9±0.3倍.表明GSH可以提高宿主菌NZ9000对H2O2所引发氧胁迫的抗性.GSH还可以提高宿主菌NZ9000对其它化学物质(如超氧阴离子自由基生成剂--甲萘醌)所引发氧胁迫的抗性.这表现在经20mmol/L甲萘醌处理60min后,前培养5h(即乳酸链球菌素诱导3h)时重组菌细胞的存活率是对照菌的6.2±0.1倍.由此表明,通过代谢工程手段在菌株NZ9000中引入GSH合成能力,可以提高宿主菌对氧胁迫的抗性.
作 者:傅瑞燕 陈坚 李寅 FU Rui-yan CHEN Jian LI Yin 作者单位:江南大学生物工程学院,工业生物技术教育部重点实验室,无锡,214036 刊 名:微生物学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA MICROBIOLOGICA SINICA 年,卷(期): 46(3) 分类号:Q93 关键词:GSH 乳酸乳球菌 氧胁迫篇3:乳酸乳球菌作为黏膜免疫活载体疫苗传递抗原的研究进展
乳酸乳球菌作为黏膜免疫活载体疫苗传递抗原的研究进展
乳酸菌是人和动物肠道内的常见细菌,被公认为安全级(generally recognized as safe,GRAS)微生物.近年来,对于乳酸菌作为宿主菌表达外源蛋白或抗原的研究取得了一定进展.乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)是乳酸菌的代表菌种,以其生长迅速、易于操作等优点成为表达外源抗原,作为黏膜免疫活载体疫苗的理想菌株.随着对乳酸乳球菌基因工程的.研究逐渐深入,已发展了一系列组成型和诱导型乳酸乳球菌表达系统以及蛋白定位系统.破伤风毒素片段C、布氏杆菌L7/L12蛋白等多种病原微生物抗原已成功在乳酸乳球菌中表达,并已证明部分重组乳酸乳球菌作为黏膜免疫疫苗可以同时刺激局部黏膜免疫应答和系统免疫应答.目前,如何使活载体乳酸乳球菌以最佳方式向黏膜免疫系统提呈抗原继而诱导有效免疫反应是该领域的研究热点,也是巨大挑战.实现外源抗原在乳酸乳球菌中的准确定位及与细胞因子的共表达是未来研究的重要方向之一.乳酸乳球菌作为黏膜免疫活载体疫苗传递外源抗原具有广阔的应用前景.
作 者:史达 宋岩 李一经 SHI Da SONG Yan LI Yi-jing 作者单位:东北农业大学动物医学学院,哈尔滨,150030 刊 名:微生物学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA MICROBIOLOGICA SINICA 年,卷(期):2006 46(4) 分类号:Q93 关键词:乳酸乳球菌 外源蛋白 抗原 黏膜免疫 疫苗篇4:乳链菌肽前体基因nisZ在乳酸乳球菌中的克隆和表达
乳链菌肽前体基因(nisZ)在乳酸乳球菌中的克隆和表达
用PCR技术从克隆有完整乳链菌肽生物合成基因簇(来自于乳链菌肽高产菌株L.LactisAL2)的重组噬菌体λHJ-3中扩增了编码乳链菌肽的前体基因,与pMG36e连接得到重组质粒pHJ201,用电击转化法将pHJ201转化到L.Lactis NZ9800中,经活性测定和Tricine-SDS-AGE电泳证实乳链菌肽前体基因获得了功能表达。DNA序列分析表明乳链菌肽高产菌株L.lactis AL2产生的`是NisinZ。发现pHJ201在L.lactis NZ9800中有良好的稳定性。
作 者:陈秀珠 胡海菁 杨巍 还连栋 作者单位:中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,北京 100080 刊 名:遗传学报 ISTIC SCI PKU英文刊名:ACTA GENETICA SINICA 年,卷(期): 28(3) 分类号:Q933 关键词:乳酸乳球菌 乳链菌肽前体基因 基因克隆 表达篇5:使用偏爱密码子大幅度提高苯丙氨酸脱氨酶在食品级乳酸乳球菌中的表达
使用偏爱密码子大幅度提高苯丙氨酸脱氨酶在食品级乳酸乳球菌中的表达
为获得苯丙氨酸脱氨酶(PAL)在食品级乳酸乳球菌中的高效表达,将欧芹pal cDNA(palnat)及根据乳酸乳球菌偏爱密码子设计人工合成的pal基因(palart)重组并转化到两种乳酸乳球菌NICE诱导表达系统中,测定基因工程菌表达PAL酶的量及活性,对比分析密码子偏爱性对乳酸乳球菌表达外源蛋白的'影响.结果表明:在两种乳酸乳球菌NICE表达系统中,使用偏爱密码子均可显著提高PAL酶的表达效率,使NZ9000/pNZ8048表达系统表达量提高22.23倍,NZ3900/pNZ8149系统提高35.90倍.此研究获得了安全高效表达PAL,可用于治疗苯丙酮尿症的基因工程菌.
作 者:陈星 高斌 贾兴元 苏畅 吕月平王战勇 范新萍 肖白 刘敬忠 CHEN Xing GAO Bin JIA Xing-Yuan SU Chang L(U) Yue-Ping WANG Zhan-Yong FAN Xin-Ping XIAO Bai LIU Jing-Zhong 作者单位:陈星,高斌,CHEN Xing,GAO Bin(首都医科大学附属朝阳医院基础医学研究中心,北京,100020;首都医科大学,北京,100054)贾兴元,苏畅,吕月平,王战勇,范新萍,肖白,刘敬忠,JIA Xing-Yuan,SU Chang,L(U) Yue-Ping,WANG Zhan-Yong,FAN Xin-Ping,XIAO Bai,LIU Jing-Zhong(首都医科大学附属朝阳医院基础医学研究中心,北京,100020)
刊 名:生物工程学报 ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 22(2) 分类号:Q786 关键词:苯丙氨酸脱氨酶 乳酸乳球菌 NICE表达系统 密码子篇6:大数据与统计学分析方法比较论文
大数据与统计学分析方法比较论文
基于理念分析和比较研究方法,对大数据的分析方法和传统统计学分析方法的关联性和差异进行了对比分析,从方法的基本思想、量化形式、数据来源、分析范式、分析方法、分析视角等角度揭示了两种社会科学分析方法存在的联系与差异。
随着信息技术的日益发展与普及,信息以及数据在社会经济发展过程中发挥的作用越来越重要。现如今,“大数据”时代已经来临,于是如何更有效地利用数据快速做出科学决策也已成为众多企业甚至是国家所共同关注的焦点问题。在数据处理和分析方法方面,《统计学》以及在其基础上发展而来的实证统计方法是当前的主流,这些方法可以帮助数据持有者从大量的数据中挖掘有价值的信息,并为其相关决策提供理论支撑和方法支持。然而,传统的实证统计方法在最新出现的大数据情境下,却呈现出了诸多缺陷,例如传统数据收集方法无法实现大规模(甚至是总体)数据的收集,传统统计方法和分析软件无法处理大规模数据,等等。于是,在将传统统计学方法应用于最新的大数据情境和问题之前,需要首先明确大数据所要求的处理方法与传统的统计学处理方法存在哪些关联和区别,然后才能够决定是否可以应用既有统计学理论和方法来处理某些大数据问题。
1、大数据的界定
根据一位美国学者的研究,大数据可以被定义为:it means data that’s too big, too fast, or too hard for existing tools to process。也就是说,该学者认为:在关于大数据的所有定义中,他倾向于将之定义为那类“太大”、“太快”,或现存工具“太难”处理的数据。一般而言,大数据的特征可以概括为四个V:一是量大(Volume);二是流动性大(Velocity),典型的如微博;三是种类多(Variety),多样性,有结构化数据,也有半结构化和非结构化数据;四是价值大(Value),这些大规模数据可以为持有企业或者组织创造出巨大的商业或社会价值。
Victor在其最新著作《大数据时代——生活、工作与思维的大变革》中指出,大数据时代,思维方式要发生3个变革:第一,要分析与事物相关的所有数据,而不是依靠分析少量数据样本;要总体,不要样本。第二,要乐于接受数据的纷繁复杂,而不再追求精确性。第三,不再探求难以捉摸的因果关系,应该更加注重相关关系。这些变革反映出了大数据处理方式与传统统计学分析方法的很多关联以及主要不同。因此,下面我们分别针对两者的联系和区别进行讨论。
2、大数据与统计学分析方法的联系
从18世纪中叶至今,统计学已经经历了两百多年的发展历程,不论是基础理论还是社会应用都极其坚实而丰富。大数据作为一种新兴的事物规律认知和挖掘思维,也将会对人类的价值体系、知识体系和生活方式产生重要影响,甚至引发重大改变。作为两种认知世界和事物规律的基本方法,它们在以下两个方面存在紧密关联。
(1)挖掘事物规律的基本思想一致。统计学(statistics)探索事物规律的基本方法是:通过利用概率论建立数学模型,收集所观察系统的数据,进行量化分析和总结,做出推断和预测,为相关决策提供依据和参考。对于大数据,维克托指出,大数据思维的来临使人类第一次有机会和条件,在非常多的领域和非常深入的层次获得和使用全面数据、完整数据和系统数据,深入探索现实世界的规律,获取过去不可能获取的知识。通过这两个定义可以看出,不论是传统的统计学方法还是新兴的大数据分析方法,都是以数据为基础来揭示事物特征以及发展趋势的。
(2)均采用量化分析方式。大数据分析的基础是数据化,也就是一种把各种各样现象转变为可制表分析的量化形式的过程。不论是传统统计学中所应用的数据(定性和定量数据),还是大数据时代即将被转化和采用其他形式数据(如文字、图像等),最终都是通过量化分析方法来揭示数据中所蕴含的事物特征与发展趋势。
3、大数据与统计学分析方法的区别
(1)基础数据不同。在大数据时代,我们可以获得和分析更多的数据,有时候甚至可以处理和某个特别现象相关的所有数据,而不再依赖于随机抽样。这意味着,与传统统计学数据相比,大数据不仅规模大,变化速度快,而且数据来源、类型、收集方法都有根本性变化。
①在数据来源方面,在大数据背景下,我们需要的纷繁多样的数据可以分布于全球多个服务器上,因此我们可以获得体量巨大的数据,甚至是关于总体的所有数据。而统计学中的数据多是经由抽样调查而获得的局部数据,因此我们能够掌握的事“小数据量”。这种情况下,因为需要分析的数据很少,所以必须尽可能精确的量化我们的数据。综上,大数据情况下,分析人员可以拥有大量数据,因而不需要对一个现象刨根问底,只需要掌握事物大体的发展方向即可;然而传统的小数据情况下则需要十分注意所获得数据的精确度。
②在数据类型与收集方面,在既往模式下,数据的收集是耗时且耗力的,大数据时代所提出的“数据化”方式,将使得对所需数据的收集变得更加容易和高效。除了传统的数字化数据,就连图像、方位、文本的字、词、句、段落等等,世间万物都可以成为大数据范畴下的数据。届时,一切自然或者社会现象的事件都可以被转化为数据,我们会意识到本质上整个世界都是由信息构成的。
(2)分析范式不同。在小数据时代,我们往往是假想世界是如何运行的,然后通过收集和分析数据来验证这种假想。也就是说,传统统计实证分析的基本范式为:(基于文献)提出理论假设—收集相关数据并进行统计分析—验证理论假设的真伪。然而,在不久的将来,我们将会在大数据背景下探索世界,不再受限制于传统的`思维模式和特定领域里隐含的固有偏见,我们对事物的研究始于数据,并可以发现以前不曾发现的联系。换言之,大数据背景下,探索事物规律的范式可以概括为:数据观察与收集——数据分析——描述事物特征/关系。
(3)数据分析方法不同。传统统计学主要是基于样本的“推断分析”,而大数据情境下则是基于总体数据的“实际分析”,即直接得出总体特征,并可以分析出这些特征出现的概率。
(4)分析视角不同。传统的实证统计意在弄清事物之间的内在联系和作用机制,但大数据思维模式认为因果关系是没有办法验证的,因此需要关注的是事物之间的相关关系。大数据并没有改变因果关系,但使因果关系变得意义不大,因而大数据的思维是告诉我们“是什么”而不是“为什么”。换言之,大数据思维认为相关关系尽管不能准确地告知我们某事件为何会发生,但是它会提醒我们这件事情正在发生,因此相关关系的发现就可以产生经济和社会价值了。
4、结语
综上,相对于传统而言,大数据思维主要包括三个重大转变。首先,要分析与某事物相关的所有数据,而不是依靠分析捎来能够的数据样本;其次,研究人员应乐于接受数据的纷繁复杂,而不再追求精确性;最后,认知世界的思想发生了转变,不再探求难以捉摸的因果关系,转而关注事物的相关关系。以上三个转变构成了大数据思维的核心。在统计学的进一步应用和发展完善过程中,需要结合以上转变所产生的挑战,思考有效的统计学发展对策。
篇7:乳酸乳球菌NICE系统食品级分泌表达载体pRNV48的构建及铜绿假单胞菌
乳酸乳球菌NICE系统食品级分泌表达载体pRNV48的构建及铜绿假单胞菌融合外膜蛋白的表达
乳酸菌NICE系统是目前较理想的可控制蛋白质生产的.食品级诱导表达系统,而乳酸菌分泌表达异源蛋白比细胞质表达更优越.本研究将以pVE5524为模板PCR扩增的1.5kb SPUsp45-NucA-CWAM6-t1t2基因克隆到食品级细胞内诱导表达载体pRNA48上,构建成食品级细胞壁锚定表达载体pRNV48,与宿主菌L.lactis NZ9000共同构成乳酸乳球菌食品级细胞壁锚定诱导表达系统.为检测该系统的功能,将铜绿假单胞菌融合外膜蛋白基因OprF/H克隆进pRNV48中,并检测了OprF/H的表达量和免疫原性.
作 者:徐波 曹郁生 陈燕 郭兴华 XU Bo CAO Yu-sheng CHEN Yan GUO Xing-hua 作者单位:徐波,XU Bo(食品科学教育部重点实验室,南昌大学中德联合研究院,江西,南昌,330047;江西农业大学,生物工程系,江西,南昌,330045)曹郁生,陈燕,CAO Yu-sheng,CHEN Yan(食品科学教育部重点实验室,南昌大学中德联合研究院,江西,南昌,330047)
郭兴华,GUO Xing-hua(中国科学院,微生物研究所,北京,100080)
刊 名:江西农业大学学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS 年,卷(期):2006 28(5) 分类号:Q93 关键词:乳酸乳球菌 食品级载体 NICE系统 OprF/H文档为doc格式